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                RNA甲基化(m6A)数据分析与课题∑设计

                RNA甲基化(m6A)数据分析与课题设计研讨会

                【会议背景】

                6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是指腺嘌呤◤(A)的第6 位氮(N)原子上发生的甲基化修饰。m6A修饰是mRNA与lncRNA最常见的核苷酸修饰。m6A修饰广泛分布于真核生物的RNA 中,m6A修饰调节RNA 成熟、剪切、转运、降解及翻译等代■谢过程。m6A修饰蛋白或者m6A结合蛋白的表达异常或m6A 修饰水平异常,可导致m6A 修饰相关RNA 代谢的异常,影响基因的表达,与很多疾病发生发展有密切关系,m6A成为了近年来的研究热点◇,很多国自然或者博士课题都想搭上该热点。

                 

                当前高分文章发表及国家自然基金支持情况均反映表观及RNA甲基化,尤其是m6A已成为当前学术研究的热点方〖向,是一个增长迅速、拥有巨大研究意义的新兴领域。鉴于表观/RNA甲基化具有重要的临床研究意义,我们特别邀请到在该领域拥有丰∑ 富经验的专家老师为大家详细的介绍表观/RNA甲基化的研究内容、研究方向及课题思路,并通过培〖训使学员熟练的掌握甲基化相关课题的数据获得和分析过程,迅速成为表观遗传领域的主力军。

                基础的m6A机制研究,如

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                m6A与外泌体结合

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                m6A与非编码RNA结合

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                m6A与自噬

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                肿瘤干性、侵袭转移相关

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                【会议目标】

                由多年从事表观遗传与RNA甲基化的科研人员授课,通过深入浅出的理论讲解和实例案例,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平,增加职业竞争力。通过本次课程培训将使学员系统掌握当前主流的表观遗传与RNA甲基化分析流★程、方法和」软件,国自然课题设计思路,从零基础◤实现到CNS图表的绘制,同时提升研究深度和广度,拓宽研究思↙路。

                【授课专家】

                来自中科院,长期从事表观遗■传学多组学方面的项目研究,发表Nature等杂志四十多篇论文。目前承担国家科¤技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。

                【主要内容】(详细︼内容参见日程)

                1RNA甲基化功能机制、研究策略及思路分析

                2RNA甲基化◣测序和数据分析

                3RNA甲基化多组学整合分析思路及课♀题设计

                4利用公共数据库和多组学@数据进行甲基化课题设计及基金申请

                【授课方式】

                1、理论结合实操;

                2、案例讲解分析结合;

                3、协助分析学员的实际数据

                【详◣细日程表见下表】


                RNA甲基化(m6A)数据分析与◥课题设计会议日程

                日期

                时间

                大纲

                详细内容

                周六上午(理论)

                8:30-10:30

                RNA甲基化功能机制

                1.RNA甲基化研究概述█

                2.RNA甲基化类型、特征、生成和作用机制

                3.RNA甲基化对RNA加工代谢的调控

                4.RNA甲基化调控多种生物学功能的作≡用机理

                10:45-12:00

                RNA甲基化研∮究策略及◆思路分析

                1.RNA甲基化在疾病等领域中的研究应用

                2.通过高分文∑ 献解读并总结RNA甲基化调控肿瘤研究思路


                12:00-13:30

                午餐及∑午休

                周六下午(理论+实操)

                13:30-15:30

                RNA甲基化测序和数据分析(一)

                1.RNA甲基化研究技术路线概览。

                2.RNA甲基化常用的各种测序技术

                3.m6A甲基化的研究思路和分析内容

                4.m6A测序技术╳流程介绍及测序报告解读

                15:45-18:00

                RNA甲基化测序和数据分析(二)

                5.m6A甲基化测序的项目延伸及思路√拓展

                6.m6A peak鉴定(R包exomePeak、MACS2)、peak差异分析 (R包exomePeak)、motif分析(Homer、MEME)及peak分布(RMBase)等


                周日上午(理论)

                8:30-10:30

                 

                RNA甲基化多组学整合分析思◎路及课题设计(一)

                1.RNA甲基化与RNA甲基化蛋白功◣能网络研究

                2.整合多组学探索RNA甲基化的功能和机★制

                3.RNA甲基化与RNA-seq、Ribosome profiling等数据整合分析

                10:45-12:00

                 

                RNA甲基化多组学整合分析思路及课题设计(二)

                4.非编码RNA(miRNA、circRNA及lncRNA等)的RNA甲基化分■析思路

                5.RNA甲基∩化研究策略、课题设计与经验交流

                6.RNA甲基化相关国自然课题介绍


                12:00-13:30

                午餐及㊣午休

                周日下午(理论+实操)

                13:30-15:30

                利用□ 公共数据库和多组学数据进行甲基化课题设计及基金申请(一)

                1.通过TCGA,GEPIA,ENCORI等数据库挖掘RNA甲基化癌症研究▽思路

                2.通过RNA甲∩基化常用数据库(RMBase,m6AVar,MeT-DB,whistle)等明∑ 确关键基因的修饰位点

                3.预测RNA甲基化位点在线工具介绍

                4.RNA甲基化修饰基因功能富集分析(DAVID,Metascape等)

                15:45-17:30

                利用公共数据库和多组学数据进行甲基化课题设计及基金申请(二)

                5.RNA甲基化研究常见图形绘制:分布趋势图,饼图,热图,韦恩图,火山图,散点图,GO、KEGG富集图,网络图,累●积曲线图,GSEA图等

                6.RNA甲基化基金申请写作思路、准备内容及方案设计注意事项等

                7.讨论及个ζ 性化问题答疑

                备注

                上∏课使用软件为RRstudio


                会议时间:每季度召开一次,具体以公众号通知为准。

                会议地点:线上:腾↘讯会议网络会议室

                          线下:北京,上海,广州等


                主办方:上海遐永医药科技有限→公司

                收费标准:线上:2800元/人;线下面授:3200元/人

                优惠政策:

                1. 提前确认报名及转账的,可以提前█拿到学习材料

                2. 三人组◥团报名,每人优惠100元

                3. 四人组团「报名,每人优惠200元,

                4. 五人组团报〓名缴费,额外带≡一人免费注册! 

                可以开正规会务发票,纸质邀▆请函(盖红章)。 

                注意事项:携带windows系统的电脑,安装最新版本R和Rstudio